В проточных схемах используется цеховая техническая вода, которая содержит соли и примеси. Это приводит к образованию накипи, коррозии и быстрому выходу из строя индукторов и силовой электроники. Кроме того, проточные системы требуют больших объёмов воды и подключения к водопроводу.
Закрытый контур работает автономно: циркулирует дистиллированная вода или антифриз, поддерживается заданная температура и давление. Такая схема исключает отложения, снижает расход воды и позволяет использовать установки ТВЧ там, где нет централизованного водоснабжения. В результате оборудование служит дольше, а эксплуатационные расходы значительно ниже.